Je vois que pour les maj on a exactement la même procédure !
Faire un effacement sécurisé de la carte pour bien écraser les données présentes, ensuite reformater dans l'appareil ?
Je pense aussi à autre chose : j'ai cru comprendre que tu utilises 2 cartes, une jpeg et une raw ; tu pourrait tester avec un autre mode où tu n'écris que sur une seule carte.
Mais tu as peut être déjà regardé ça....